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來源: 發布時間:2021-11-07

PCR引物設計的原則PCR反應中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設計引物時以一條DNA單鏈為基準(常以信息鏈為基準),5′端引物與位于待擴增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴增片段3′端的一小段DNA序列互補。(1)引物設計的基本原則引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現非特異條帶。ATGC比較好隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。引物內部不應出現互補序列。兩個引物之間不應存在互補序列,尤其是避免3′端的互補重疊。引物與非特異擴增區的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續8個堿基在待擴增區以外不能有完全互補序列,否則易導致非特異性擴增。引物3‘端的堿基,特別是較末及倒數第二個堿基,應嚴格要求配對,比較好選擇是G和C。引物的5′端可以修飾。如附加限制酶位點,引入突變位點,用生物素、熒光物質、地高辛標記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。pcr檢測樣本的保存要求與方法?江西熒光定量pcr公司

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PCR的假陽性主要原因之一出現非特異性擴增帶:PCR擴增后出現的條帶與預計的大小不一致,或大或小,或者同時出現特異性擴增帶與非特異性擴增帶。非特異性條帶的出現,其原因:一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環次數過多有關。其次是酶的質和量,往往一些來源的酶易出現非特異條帶而另一來源的酶則不出現,酶量過多有時也會出現非特異性擴增。其對策有:必要時重新設計引物。減低酶量或調換另一來源的酶。降低引物量,適當增加模板量,減少循環次數。適當提高退火溫度或采用二溫度點法(93℃變性,65℃左右退火與延伸)。PCR的假陽性主要原因之一出現片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴增有時出現涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,退火溫度過低,循環次數過多引起。其對策有:減少酶量,或調換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度。適當降低Mg2+濃度。增加模板量,減少循環次數。浙江細胞pcr要多久pcr檢測實驗數據如何分析?

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PCR實驗技術中的錨定PCR(AnchoredPCR)介紹:錨定PCR主要用于分析具有可變末端的DNA序列,Loh等用A-PCR對人外周血淋巴細胞T細胞受體α-鏈的mRNA的多變性進行了分析。先合成cDNA,并用末端脫氧核苷酸轉移酶在其3’-可變區末端加上一個PolyG尾巴。Loh等恒定區與可變區連接部位設一個引物,另一個引物是一個具5’-polyG尾巴的引物。帶有PolyG尾巴的引物是一個固定點,它可以并與PolyG尾巴結合,無論其余部分序列如何,只識別片段末端,利用此法可從前述mRNA中檢出至少20種不同序列,每一種都是獨特的,表明A-PCR不對任何特殊序列有傾向性結果,可用于T細胞及其它部位抗體基因的研究。

PCR原理:PCR是在試管中進行的DNA復制反應,基本原理是依據細胞內DNA半保留復制的機理,以及體外DNA分子于不同溫度下雙鏈和單鏈可以互相轉變的性質,人為地控制體外合成系統的溫度,以促使雙鏈DNA變成單鏈,單鏈DNA與人工合成的引物退火,然后耐熱DNA聚合酶以dNTP為原料使引物沿著單鏈模板延伸為雙鏈DNA。PCR全過程每一步的轉換是通過溫度的改變來控制的。需要重復進行DNA模板解鏈、引物與模板DNA結合、DNA聚合酶催化新生DNA的合成,即高溫變性、低溫退火、中溫延伸3個步驟構成PCR反應的一個循環,此循環的反復進行,就可使目的DNA得以迅速擴增。DNA模板變性:模板雙鏈DNA?單鏈DNA,94℃。退火:引物+單鏈DNA?雜交鏈,引物的Tm值。引物的延伸:溫度至70℃左右,TaqDNA聚合酶以4種dNTP為原料,以目的DNA為模板,催化以引物3’末端為起點的5’→3’DNA鏈延伸反應,形成新生DNA鏈。新合成的引物延伸鏈經過變性后又可作為下一輪循環反應的模板PCR,就是如此反復循環,使目的DNA得到高效快速擴增。一步法熒光定量pcr在哪做?

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PCR的假陽性主要原因之一引物設計不合適:選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性,因而在進行PCR擴增時,擴增出的PCR產物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現假陽性。需重新設計引物。靶序列或擴增產物的交叉污染:這種污染有兩種原因:一是整個基因組或大片段的交叉污染,導致假陽性。這種假陽性可用以下方法解決:操作時應小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣器內或濺出離心管外。除酶及不能耐高溫的物質外,所有試劑或器材均應高壓消毒。所用離心管及樣進器頭等均應一次性使用。必要時,在加標本前,反應管和試劑用紫外線照射,以破壞存在的核酸。二是空氣中的小片段核酸污染,這些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,與引物互補后,可擴增出PCR產物,而導致假陽性的產生,可用巢式PCR方法來減輕或消除。pcr儀的使用說明是什么?山東有哪些pcr公司

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pcr防止污染的方法(一)合理分隔實驗室:將樣品的處理、配制PCR反應液、PCR循環擴增及PCR產物的鑒定等步驟分區或分室進行。(二)吸樣器:吸樣器污染是一個值得注意的問題。由于操作時不慎將樣品或模板核酸吸入器內或粘上器頭是一個嚴重的污染源,因而加樣或吸取模板核酸時要十分小心。(三)預混和分裝PCR試劑:所有的PCR試劑都應小量分裝,如有可能,PCR反應液應預先配制好,然后小量分裝,-20℃保存。以減少重復加樣次數,避免污染機會。另外,PCR試劑,PCR反應液應與樣品及PCR產物分開保存,不應放于同一冰盒或同一冰箱。(四)防止操作人員污染,使用一次性手套、吸頭、小離心管應一次性使用。(五)設立適當的陽性對照和陰性對照,陽性對照以能出現擴增條帶的比較低量的標準病原體核酸為宜,并注意交叉污染的可能性,每次反應都應有一管不加模板的試劑對照及相應不含有被擴增核酸的樣品作陰性對照。(六)減少PCR循環次數,只要PCR產物達到檢測水平就適可而止。(七)選擇質量好的Eppendorf管,以避免樣本外溢及外來核酸的進入,打開離心管前應先離心,將管壁及管蓋上的液體甩至管底部。江西熒光定量pcr公司

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