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海洋生物外泌體miRNA芯片

來源: 發布時間:2023-04-04

被特定部位的細胞獲取的瘤子外泌體可為肉瘤的轉移準備轉移前微環境。用肺轉傾向的肉瘤細胞來源的外泌體處理小鼠后可使骨轉傾向的肉瘤細胞重新定向。外泌體的蛋白質組學分析發現不同部位傾向性的肉瘤細胞來源的外泌體具有不同的整合素(integrin)表達譜,整合素α6β4和α6β1與肺轉有關,而整合素αvβ5與肝轉有關。敲低整合素α6β4和αvβ5可減少外泌體被靶部位細胞獲取,進而分別降低了肺和肝的轉移。進一步研究發現外泌體整合素被細胞獲取后活躍了Src的磷酸化和促炎的S100基因的表達。通過臨床數據分析顯示外泌體整合素可作為預測肉瘤轉移的部位傾向性的診斷指標。采用磁珠法時,外泌體生物活性易受PH和鹽濃度影響。海洋生物外泌體miRNA芯片

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流式細胞技術是細胞和小顆粒定性和定量表征的有效方法,其用于外泌體定量檢測的準確性也在不斷上升。將外泌體表面特異性標志物CD63、CD81等相應抗體進行標記,可用流式細胞儀檢測到陽性表達,從而實現對外泌體的定量。但流式細胞技術檢測時需要單顆粒懸浮液,當外泌體濃度高或分離過程中發生外泌體囊泡聚集時將導致一次觀察到多個顆粒,從而導致數據不準確。因此,為了通過流式細胞儀觀察,需要將外泌體通過免疫捕獲或共價結合固定在磁珠表面上,從而便于將外泌體囊泡暴露于已知或者預期在外泌體表面表達的抗原的熒光偶聯抗體中。在流式細胞術之前,可以在落射熒光顯微鏡(EPI)下觀察與磁珠和熒光抗體偶聯的外泌體囊泡。當樣品通過流式細胞儀時采集熒光信號,不只可以對外泌體進行高通量分析,還可以基于抗原表達對外泌體進行定量或分類。杭州腹膜透析液外泌體外泌體膜蛋白可以被蛋白酶剪切,剪切的碎片可以作為配體與細胞膜上的受體結合,從而活躍細胞內的信號通路。

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超速離心是外泌體提取較常用的方法也被認為是金標準,主要是根據外泌體的沉降系數、大小和形狀將其分離出來。首先4℃低速離心(300-500g,10min)去除死細胞以及細胞碎片,隨后以較高離心速度(2000xg,10min)去除生物聚合物以及凋亡小體,然后用10000xg,30min離心去除大型囊泡,結尾以超速離心沉淀外泌體。通過懸浮以及重復超速離心去除外泌體沉淀中的非外泌體蛋白。超速離心法具有操作簡單、不易被分離試劑污染、獲得的外泌體數量較多等優點。但是此方法需要昂貴的超高速離心機,每次處理的樣本量較小,費時,電鏡鑒定時還發現外泌體易聚集成塊,且上清中仍能檢測到大型囊泡,純度不高,另外高速離心會損傷外泌體影響下游實驗。外泌體通過內體途徑分泌到細胞外空間,并將各種生物活性分子(貨物)轉運至靶細胞。

質膜的連續內陷較終導致多泡體的形成,多泡體可與細胞內的其他囊泡和細胞器交叉,從而增加了外泌體成分的多樣性。根據細胞來源的不同,細胞外囊泡,包括外泌體,可以包含細胞的許多成分,包括DNA、RNA、脂質、代謝物、胞質和細胞表面蛋白。目前產生外泌體的生理目的尚不清楚,需要進一步研究。一個推測的作用是外泌體可能從細胞中去除多余和/或不必要的成分以維持細胞內環境的穩定。較近的研究也表明外泌體中特定細胞成分的功能、靶向、機制驅動的積累,提示它們在調節細胞間通訊中發揮作用。外泌體是指包含了復雜RNA和蛋白質的小膜泡(30-150nm)。

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近年來,外泌體的捕獲技術越來越多,微流體系也被用于外泌體提取,此方法能根據其物理和生化特性同時分離外泌體。采用這種方法獲得的樣品純度高,且可及時獲取外泌體用于疾病的相關檢測。在初次注射時外泌體粘附在微流控設備的內表面,并在隨后的PBS注射中沖洗掉。此方法采用的設備復雜,所需的樣本量取決于流動通道的長度。另外,樣品量的注入速率比較低,因此,對于大樣品量,將需要較長的處理時間。外泌體在包括瘤子在內的各種疾病的發病機理中具有重要的功能。目前,研究人員已經開發了多種方法來分離外泌體,離心技術仍然是常用方法,其他方法,例如過濾、磁珠分離和色譜法等,也顯示出獨特的優勢,但目前仍然沒有一種公認有效的提取方法,研究人員應針對不同來源的樣本以及不同的下游分析選取較適宜的提取方案。外泌體屬于胞外囊泡類,除了外泌體之外細胞還分泌微泡以及其它的膜囊泡。pkh67

對外泌體的分析和檢測可以輔助疾病的早期診斷、療效評價和預后分析。海洋生物外泌體miRNA芯片

密度梯度離心法根據在蔗糖、碘海醇或碘克沙醇等惰性溶液中的浮力密度將外泌體分成特定的層,目前普遍應用的是蔗糖,這種方法可以成功地將亞細胞成分(例如過氧化物酶體,線粒體和核內體)分離到密度梯度溶液中的不同層中。樣品被放置在梯度的頂部,當施加離心力時,樣品中的顆粒以獨特的速率通過梯度,該梯度以從上到下的密度增加。樣品中的外泌體將在1.13-1.19g/ml的密度范圍富集,隨后可以通過分餾收集,密度梯度超速離心對從蛋白質聚集體和非膜顆粒中分離出外泌體非常有效。此方法獲得的外泌體純度較高,但步驟繁瑣、費時且會造成外泌體損失。海洋生物外泌體miRNA芯片

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