我們知道WB實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣,一次實(shí)驗(yàn)歷時(shí)也不短,從提蛋白到顯影結(jié)束可能要三天,我們就講一下這里面的一些關(guān)鍵環(huán)節(jié)。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經(jīng)驗(yàn)豐富的WB實(shí)驗(yàn)者都深有體會(huì),蛋白提取是影響結(jié)重要的環(huán)節(jié)之一。該過程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點(diǎn),一是裂解前注意保持樣品處于低溫環(huán)境中,二是裂解時(shí)加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習(xí)慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環(huán)灌注,然后冰上取腦,分離各腦區(qū)(嗅球,皮層,海馬,中腦,小腦,延髓,丘腦,紋狀體)后置于,用液氮速凍后轉(zhuǎn)移至-80度冰箱長期保存。接著是保證蛋白濃度,即要加入適量的裂解液,加太少會(huì)使蛋白提取不充分,加太多會(huì)讓蛋白濃度太低,一般經(jīng)驗(yàn)是這樣的,細(xì)胞樣品例如一個(gè)六孔板的細(xì)胞加60微升的裂解液,動(dòng)物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理,具體方案見討論部分。如果沒有超聲破碎儀,那就用1毫升注射器不斷抽吸,冰上反復(fù)抽吸1分鐘左右,注意不要產(chǎn)生過多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取,由于文件過大,又比較血腥,不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘,這里的上樣緩沖液有兩種可選。protocol 分享|小鼠卵巢組織切片 HE 染色。黑龍江實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)

RNA各種可逆的化學(xué)修飾被認(rèn)為是一種新的表觀遺傳調(diào)控方式。m6A是真核生物mRNA常見的化學(xué)修飾,在調(diào)控mRNA穩(wěn)定性,剪切和翻譯方面具有重要的作用。作者使用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)了METTL3(甲基轉(zhuǎn)移酶3),一種主要的RNAN6-腺苷-甲基轉(zhuǎn)移酶,在人肝細(xì)胞(HCC)和多種實(shí)體中高表達(dá)。在臨床上,METTL3的過度表達(dá)與肝細(xì)胞患者不良預(yù)有關(guān)。體外實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)抑制HCC細(xì)胞增殖,遷移及克隆形成。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證明敲除METTL3會(huì)明顯抑制HCC體內(nèi)成瘤和肺轉(zhuǎn)移。另外,使用CRISPR/dCas9-VP64系統(tǒng),內(nèi)源性高表達(dá)METTL3會(huì)促進(jìn)HCC細(xì)胞在體外和體內(nèi)生長。通過轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、m6A-Seq、MeRIP-PCR,作者確定了SOCS2(細(xì)胞因子信號(hào)2的抑制因子)作為METTL3介導(dǎo)的m6A修飾的下游靶基因。敲除METTL3表達(dá)會(huì)消除SOCS2mRNAm6A修飾并增強(qiáng)SOCS2mRNA表達(dá)。m6A介導(dǎo)的SOCS2mRNA降解是依賴于m6A“讀取器”蛋白YTHDF2。總之,METTL3在HCC大部分高表達(dá)中,并通過m6A-YTHDF2依賴機(jī)制抑制SOCS2表達(dá)從而促進(jìn)HCC進(jìn)展。因此,作者發(fā)現(xiàn)了在肝發(fā)生過程中表觀遺傳改變的一種新機(jī)制。圖4RNA甲基化轉(zhuǎn)移酶METLLT3在肝組織中高表達(dá)。寧夏小鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)隨著科技的不斷進(jìn)步,科研人員將能夠開發(fā)出更為精確、實(shí)用的動(dòng)物模型,更好地為人類健康保駕護(hù)航。

注意事項(xiàng)1.病毒包裝的幾個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)主要包括:細(xì)胞因素、載體系統(tǒng)(盡量使用成熟的商業(yè)化載體系統(tǒng))、構(gòu)建重組的質(zhì)粒正確與否、質(zhì)粒抽提純化情況、包裝轉(zhuǎn)染控制(24、48小時(shí)的細(xì)胞及熒光狀態(tài)判斷)、目的基因?qū)Σ《景b影響(基因大小、序列情況、蛋白功能毒性等都會(huì)影響到是否能包裝成功)。,需要觀察包裝病毒后的48h培養(yǎng)基顏色是否橙紅。3.病毒濃縮:病毒一般在48h和72h各收一次。如果不想濃縮病毒的話,也可以直接將收集的病毒上清作為要的細(xì)胞的培養(yǎng)基,但是可能效果會(huì)不太好。并且一般收病毒時(shí),培養(yǎng)基的營養(yǎng)已經(jīng)損耗了很多,那樣直接培養(yǎng)細(xì)胞會(huì)損害細(xì)胞,所以建議還是進(jìn)行濃縮后再。常見問題1.包裝病毒時(shí)293T細(xì)胞狀態(tài)不好,或者鋪得過密,可以選擇放棄該次實(shí)驗(yàn)。2.目的載體過大,不易。3.避免轉(zhuǎn)染過程以及后續(xù)過程出現(xiàn)的污染。
代謝組學(xué)的研究對(duì)象大都是相對(duì)分子量在1000以內(nèi)的小分子物質(zhì),因此常用的血液樣本在取樣后,應(yīng)小心操作,防止溶血,盡快分離出血清,分置于溫環(huán)境下保存。由于用于理實(shí)驗(yàn)的動(dòng)物采集相對(duì)其他樣品的采集,操作更繁瑣,在處理過程中許多細(xì)節(jié)容易忽略,造成數(shù)據(jù)不完美(甚至不能用)。因此接下來將重點(diǎn)介紹樣品采集的注意事項(xiàng)及其固定。樣品采集注意事項(xiàng)應(yīng)新鮮,操作時(shí)間盡可能短,否則細(xì)胞發(fā)生死后變化、自融及現(xiàn)象。是動(dòng)物心臟還在跳動(dòng)時(shí)采集,樣本取出后在5分鐘以內(nèi)置于固定液內(nèi),避免長時(shí)間暴露在空氣環(huán)境中。塊盡量小而薄。塊的厚度以不超過5mm為宜,較為理想的厚度為2mm左右,主要目的是使固定液迅速而均勻的滲入塊內(nèi)部。勿使塊受擠壓。在采集過程中,應(yīng)盡量選擇較為鋒利的手術(shù),如手術(shù)刀片等,避免操作過程中擠壓挫傷標(biāo)本。擠壓過的均不可用。固定液的量一般以塊大小的20倍為宜,能夠在容器內(nèi)自由移動(dòng)。盡量保持的原有形態(tài)。新鮮經(jīng)固定后,或多或少產(chǎn)生收縮現(xiàn)象(如胃腸),為此可將展平,以盡可能維持原形。保持清潔。塊上如有血液、污物、粘液、食物、糞便等,可用生理鹽水沖洗,然后再入固定液,但要注意防止損傷。要熟悉采集部位。要能準(zhǔn)確的按解剖部位采集。培養(yǎng)基有很多不同的名字是因?yàn)楦鶕?jù)不同細(xì)胞的培養(yǎng)和應(yīng)用場景。

靜置25分鐘后把酒精倒干,用吸水紙吸出多余的酒精,然后配壓縮膠,同樣的操作,關(guān)鍵是梳子要插得快,要小心梳子下產(chǎn)生氣泡,然后靜置30分鐘。如果是當(dāng)天跑膠,我會(huì)等上層膠凝2個(gè)小時(shí)再用,但要注意防干燥縮水,可以在一個(gè)小時(shí)的時(shí)候沿著梳子上緣加點(diǎn)電泳液。所以我一般提前一晚制膠,泡于純水或者電泳液里置于4度冰箱暫存。三、蛋白電泳1、上樣前準(zhǔn)備把膠組裝到電泳芯上,注意密閉性(否則漏液),如果內(nèi)槽漏液就不是勻強(qiáng)電場了,條帶可能就不是一條直線。然后內(nèi)槽倒?jié)M電泳液,拔梳子,這一步要小心,梳子要兩邊一起緩緩?fù)习纬觯缓笥^察泳道內(nèi)有無脫落的膠粒或者膠絲,有的話用1毫升注射器吸出。然后從冰箱取出蛋白樣品,解凍。準(zhǔn)備振蕩器。2、上樣和電泳注意,上樣后蛋白會(huì)開始慢慢在膠中彌散,所以上樣越快越好。我習(xí)慣先上蛋白Marker,再上蛋白樣品,蛋白上樣前確保樣品完全解凍和充分振蕩(推薦使用振蕩器振蕩),吸的時(shí)候沒有拉絲即可,建議上樣分鐘把樣品從冰上取出來,不然樣品中SDS可能會(huì)結(jié)晶析出,從而影響電泳效果。上層膠80V25分鐘,下層膠120V65分鐘。四、轉(zhuǎn)膜1、轉(zhuǎn)膜前準(zhǔn)備我會(huì)在電泳結(jié)束0分鐘準(zhǔn)備,把轉(zhuǎn)膜液配好置于4度冰箱預(yù)冷,然后裁膜,準(zhǔn)備轉(zhuǎn)膜裝置。外泌體在生物醫(yī)學(xué)方面有哪些應(yīng)用。云南疾病模型科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室
細(xì)胞轉(zhuǎn)染又分為瞬時(shí)轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定轉(zhuǎn)染,瞬時(shí)轉(zhuǎn)染是指外源基因進(jìn)入受體細(xì)胞后.黑龍江實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)
應(yīng)退回純酒精中重新脫水,然后再透明,否則切片難以鏡檢。(4)二甲苯應(yīng)盡量保持無水,應(yīng)經(jīng)常更換,或用紗布包無水硫酸銅放入染色缸內(nèi)吸收水分。5.透蠟注意事項(xiàng)(1)透蠟的目的是除去組織中的透明劑(如二甲苯等),使石蠟滲透到組織內(nèi)部達(dá)到飽和程度以便包埋。透蠟時(shí)間根據(jù)組織大小而定。(2)盡量保持在較低溫度中進(jìn)行,以石蠟不凝固為度。(3)透蠟溫度要恒定,不可忽高忽低。(4)操作要迅速,力求在短的時(shí)間內(nèi)完成石蠟透入過程,以免引起組織變硬、變脆、收縮等。(5)注意溫度不要過高,以免組織發(fā)脆。6.染色水洗注意事項(xiàng)(1)染色原理:伊紅主要染細(xì)胞質(zhì),著色濃淡應(yīng)與蘇木精染細(xì)胞核的濃淡相配合,如果細(xì)胞核染色較濃,細(xì)胞質(zhì)也應(yīng)濃染,以獲得鮮明的對(duì)比。(2)染色時(shí)間應(yīng)根據(jù)染色劑的成熟程度及室溫高低,適當(dāng)縮短或延長。室溫高時(shí)促進(jìn)染色,染色時(shí)間可短些,否則可適當(dāng)延長時(shí)間,冬季室溫低時(shí)可放入恒溫箱中染色。(3)注意流水不能過大,以防切片脫落。(4)如果細(xì)胞核染色較淺,細(xì)胞質(zhì)也應(yīng)淡染。可在伊紅乙醇液中滴加數(shù)滴冰醋酸助染,促使細(xì)胞質(zhì)容易著色,并且經(jīng)乙醇脫水時(shí)不易褪色。黑龍江實(shí)驗(yàn)科研技術(shù)服務(wù)培養(yǎng)