與IdeS不同，融合蛋白是通過(guò)將兩種或多種蛋白質(zhì)或肽的功能組合成一個(gè)量身定制的分子來(lái)創(chuàng)造的，以專門(mén)應(yīng)對(duì)挑戰(zhàn)。連接此類蛋白質(zhì)或肽結(jié)構(gòu)域的常見(jiàn)方法是包含柔性連接子。這些連接子通常富含甘氨酸，例如甘氨酸殘基（G），或甘氨酸殘基散布絲氨酸殘基（GS）以形成重復(fù)序列。這為連接子提供了足夠的靈活性，不會(huì)干擾連接蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域的功能。然而，這些新模式帶來(lái)了新的分析挑戰(zhàn)，需要新的工具來(lái)促進(jìn)表征和產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)測(cè)。中級(jí)分析已成為分析單克隆抗體療法的標(biāo)準(zhǔn)方法，涉及將分子消化成幾個(gè)定義的亞基。它們足夠小，可以獲得高質(zhì)量的質(zhì)譜圖，并為產(chǎn)品質(zhì)量屬性提供特定領(lǐng)域的信息。由于G和GS連接子對(duì)常見(jiàn)蛋白酶的降解具有抗性，因此很難分離結(jié)構(gòu)域以進(jìn)行深入分析。因此，Genovis開(kāi)發(fā)了GlySERIAS，不同于IdeS酶，一種消化柔性富含甘氨酸的連接子的酶。GlySERIAS可以分離不同的功能域，并實(shí)現(xiàn)對(duì)融合蛋白、多特異性抗體和含有富含甘氨酸的連接子的各種mAb片段進(jìn)行詳細(xì)表征的中級(jí)方法。這就是為什么Fc/2和GLP-1肽都被檢測(cè)為幾種變體。云南FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

與IdeS不同，Genovis的GingisREX（RgpB）是一種精氨酸特異性蛋白酶，可消化精氨酸殘基的C末端蛋白質(zhì)，包括難以與其他酶消化的Arg-Pro鍵。該酶可用于肽圖分析、從頭肽測(cè)序和翻譯后修飾分析。精氨酸殘基的特異性C-末端消化；在其他困難的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化；產(chǎn)生更長(zhǎng)的肽-提高序列覆蓋率。GingisREX是一種半胱氨酸蛋白酶，可特異性地消化肽鍵C末端到精氨酸殘基，包括與脯氨酸相連的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。與胰蛋白酶消化相比，可生成更長(zhǎng)的肽，胰蛋白酶消化可以通過(guò)高分辨率質(zhì)譜進(jìn)行分離和鑒定。這為自下而上方法的樣品制備提供了更多選擇，以實(shí)現(xiàn)替代的酶解曲線和更高的序列覆蓋率。GingisREX在賴氨酸上沒(méi)有活性，通常使用Arg-C觀察到。該酶在5.0-9.0的寬pH值范圍內(nèi)具有活性，它需要半胱氨酸并被鹽酸胍抑制。該酶是從牙齦卟啉單胞菌中純化的。廣東GlySERIASIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)孵育時(shí)間為過(guò)夜（16-18小時(shí)），并且由于酶的特異性，沒(méi)有過(guò)度消化的風(fēng)險(xiǎn)。

樣品制備的條件可能會(huì)在樣品中誘發(fā)偽影，因此需要避免高溫和堿性pH值進(jìn)行質(zhì)譜分析。如果可能的話，避免多個(gè)步驟并在一鍋反應(yīng)中進(jìn)行消化和還原也可能是有益的。與IdeS不同，為了探索Genovis的GingisREX對(duì)離液劑和去液劑的穩(wěn)定性和耐受性，在一系列試劑中測(cè)試了酶活性，并使用底物測(cè)定進(jìn)行了評(píng)估。數(shù)據(jù)顯示，GingisREX在6M時(shí)耐受尿素，吐溫高達(dá)1%，但活性在0.1%時(shí)受到SDC的負(fù)面影響。該酶在 pH 值范圍為 5.0 至 9.0 時(shí)顯示出活性，在 pH 值為 6.5-8.0 之間。綜上所述，GingisREX可用于一鍋反應(yīng)，以同時(shí)消化和變性6M尿素。與Genovis的IdeS不同，雙特異性 T 細(xì)胞接合器 （BiTE） 分子是一種融合蛋白療法，其中兩個(gè) scFv 融合，形成一個(gè)雙特異性分子，其中一個(gè) scFv 靶向細(xì)胞毒性 T 細(xì)胞，另一個(gè)靶向Ai癥抗原。該蛋白質(zhì)由四個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域組成，兩個(gè) scFv 均由 VL 和 VH 區(qū)域組成，總共由三個(gè)柔性 GS 連接子連接。這種蛋白質(zhì)的大尺寸（54 kDa）可能對(duì)通過(guò)完整質(zhì)譜法進(jìn)行產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)測(cè)構(gòu)成挑戰(zhàn)，因?yàn)闃?biāo)準(zhǔn)MS儀器可能無(wú)法提供蛋白質(zhì)的單同位素分辨率。

為什么客戶想在他們的工作試用Genovis的FabRICATOR（IdeS）。FabRICATOR的高特異性(在鉸鏈下方有單個(gè)消化位點(diǎn))以及它對(duì)IgG種和亞類表現(xiàn)出活性的事實(shí)使其成為高效表征一系列不同分子的理想工具。FabRICATOR的另一大優(yōu)勢(shì)是速度。在大多數(shù)IgG上，您可以在短短30分鐘內(nèi)生成F(ab’)2和Fc/2片段，這一速度簡(jiǎn)化了方法開(kāi)發(fā)，并允許快速有效的中層表征，使客戶能夠在不比做完整質(zhì)量實(shí)驗(yàn)長(zhǎng)太多的時(shí)間內(nèi)獲得更多關(guān)于分子的信息。Genovis發(fā)現(xiàn)更多的緩沖液與溶液中的FabRICATOR消解相容（更多信息）。Genovis已經(jīng)測(cè)試了PBS和150mM醋酸銨，pH7，結(jié)果良好。并且應(yīng)該也適用于FabRICATORHPLC。然而，緩沖液的離子強(qiáng)度會(huì)影響抗體片段在FabRICATORHPLC（IdeS）色譜柱上的保留，并且IgG1亞基需要至少100-150mM鹽才能洗脫為單個(gè)窄峰。其他IgG亞類或融合蛋白可能需要對(duì)緩沖液組成進(jìn)行一些優(yōu)化。Genovis的FabRICATOR MagIC適用于自動(dòng)化平臺(tái)。

Genovis的半胱氨酸蛋白酶 FabALACTICA （IgdE）與IdeS酶一樣是特異性蛋白酶。在二維核磁共振波譜 （2D-NMR） 之后，可以通過(guò) HOS 分析在精確的原子水平上評(píng)估 mAb 的關(guān)鍵質(zhì)量屬性。從Genovis的FabALACTICA Immobilized獲得均相Fab和Fc片段的工作流程，是評(píng)估嵌合單克隆抗體英夫利昔單抗中HOS的理想選擇，在海報(bào)“FabALACTICA產(chǎn)生純和均相的mAb亞基，促進(jìn)2D-NMR波譜分析”中進(jìn)行了描述。來(lái)自生成的 Fab 和 Fc 片段的高質(zhì)量信號(hào)和光譜分辨率導(dǎo)致能夠觀察 Fab 和 Fc 之間的結(jié)構(gòu)變化、氧化和非氧化樣品之間的差異，并通過(guò)觀察原子分辨率來(lái)比較原研劑和生物仿制藥的 HOS。Genovis提供的IgASAP Sub1+2 在鉸鏈上方的一個(gè)特定位點(diǎn)消化人 IgA1 和 IgA2m1，產(chǎn)生完整且均勻的 Fab 和 Fc 片段。江蘇GlySERIASIdeS蛋白酶

Genovis亞基分析比肽圖譜具有簡(jiǎn)單快速的巨大優(yōu)勢(shì)，更適用于高通量的檢測(cè)，并可用于支持肽圖分析。云南FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

Blinatumomab（一種對(duì) CD19 和 T 細(xì)胞標(biāo)志物 CD3 具有特異性的 BiTE 分子）的研究級(jí)生物仿制藥在室溫下用固定化過(guò)夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通過(guò)LC-MS對(duì)消解樣品的直接分析表明，所有三個(gè)連接子區(qū)域均被消解，α-CD3 VL和VH鏈洗脫為一個(gè)色譜峰，α-CD19 VH和VL鏈作為單獨(dú)的峰洗脫。來(lái)自連接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 結(jié)構(gòu)域的小峰顯示該短連接子未完全消化，表明 GlySERIAS 對(duì)短連接子的活性較低。與完整的蛋白質(zhì)分析相比，四個(gè)結(jié)構(gòu)域的分離提供了具有單同位素分辨率的高質(zhì)量光譜。可以觀察到每個(gè)結(jié)構(gòu)域的幾個(gè)不同變體，剩余的連接子殘基數(shù)量不同。在色譜分離過(guò)程中，α-CD3 VH結(jié)構(gòu)域無(wú)法從α-CD19 VH結(jié)構(gòu)域完全基線分離，導(dǎo)致在相關(guān)質(zhì)譜中觀察到一些共洗脫。四個(gè)結(jié)構(gòu)域的分離產(chǎn)生了有關(guān)在完整蛋白質(zhì)水平上鑒定的蛋白質(zhì)修飾位置的信息。例如，在完整水平上鑒定的 37 Da 的蛋白質(zhì)修飾被分配給 α-CD3 VH 鏈。此外，240Da 和 320da 的兩個(gè)修飾分別被分配給 α-CD3 VL 結(jié)構(gòu)域。后者還含有一個(gè)帶有五六個(gè)組氨酸殘基的 His 標(biāo)簽。這些數(shù)據(jù)證明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 對(duì)包含多個(gè)柔性連接子蛋白進(jìn)行質(zhì)量控制的中級(jí)工作流程的強(qiáng)大功能。云南FabDELLOIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)