與肽圖譜相比，根據(jù)Genovis科學(xué)家的經(jīng)驗(yàn)，尤其是對(duì)于像抗體這樣的分子，許多人在常規(guī)實(shí)驗(yàn)中做了太多的肽圖譜，而中級(jí)水平（Middle-level）的方法可以很好地工作。中級(jí)方法（IdeS酶切抗體）需要更少的實(shí)際操作步驟和較少的示例處理，所有這些都意味著過(guò)程中出錯(cuò)的事情更少。我們的許多酶可以作為平臺(tái)方法，同樣的方法適用于絕大多數(shù)的抗體，這不是肽圖的情況下，可能需要優(yōu)化整個(gè)樣品制備，LC分離，質(zhì)譜設(shè)置和數(shù)據(jù)分析的每個(gè)不同的抗體分析。這些變化可能是很小的，但沒(méi)有一種適用于所有肽圖的方法。由于分析和數(shù)據(jù)分析的簡(jiǎn)單性，中級(jí)方法非常適合自動(dòng)化和高通量的工作流程。肽圖當(dāng)然可以自動(dòng)用于樣品制備，但高通量肽圖生成大量數(shù)據(jù)，仍然需要徹底分析。事實(shí)上，肽圖譜是一個(gè)多步驟的過(guò)程，每一個(gè)步驟都可能破壞方法，并可能導(dǎo)致破壞蛋白質(zhì)的人工制品，很難交叉訓(xùn)練給非專業(yè)人員。中級(jí)水平的方法很容易交叉訓(xùn)練，我們的方法在質(zhì)量控制實(shí)驗(yàn)室中被成功地使用。肽圖譜是一種用于修飾分析和氨基酸確認(rèn)的方法，但一旦完成了這一工作，我相信使用中級(jí)分析可以成功地更有效地完成抗體樣本的大部分工作。融合蛋白的中級(jí)分析既可以降低整體樣品的復(fù)雜性，又可以對(duì)翻譯后修飾進(jìn)行結(jié)構(gòu)域特異性鑒定和監(jiān)測(cè)。海南GingisREXIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶

不同于IdeS，Genovis的FabDELLO 是一種蛋白酶，可在鉸鏈上方的單個(gè)位點(diǎn)消化人 IgG1，在兩小時(shí)內(nèi)產(chǎn)生完整的 Fab 和 Fc 片段，無(wú)需還原條件。該酶對(duì)具有突變鉸鏈區(qū)域的抗體（如 LALA 突變）具有活性，并啟用中級(jí) LC-MS 來(lái)表征具有突變鉸鏈的抗體的關(guān)鍵質(zhì)量屬性。FabDELLO 在鉸鏈上方的單個(gè)位點(diǎn)消化人 IgG1 （...KSCDK / THTCPPCP...），生成完整的 Fab 和 Fc 片段。FabDELLO 是一種賴氨酸特異性蛋白酶。單個(gè)消化位點(diǎn)是人 IgG1 的三維結(jié)構(gòu)的結(jié)果，使這種賴氨酸暴露于酶中。如果去除N-聚糖，則Fc上暴露的賴氨酸處可能會(huì)出現(xiàn)額外的消化位點(diǎn)。FabDELLO在天然條件下具有活性，需要鈣離子的存在。在37°C和pH 7-8.5下獲得良好活性。FabDELLO 是從 Bdellovibrio 細(xì)菌克隆而來(lái)的，并在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有 His 標(biāo)簽，分子量為 32 kDa。四川FabULOUSIdeS蛋白酶抗體酶切幾乎完全消化了Fc結(jié)構(gòu)域中的連接子，留下了接近均質(zhì)的Fc/2產(chǎn)物。

Genovis的FabRICATOR是一種半胱氨酸蛋白酶，它對(duì)許多不同的物種和IgG亞類都有活性，包括人IgG亞類1-4以及猴子、兔子、大鼠和綿羊IgG的一些亞類。FabRICATOR在鉸鏈下方的單個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行消化，生成F(ab’)2和Fc/2子基，可以進(jìn)一步還原生成Fd’，輕鏈和F/2子基是必需的。FabRICATOR（IdeS）通過(guò)蛋白-蛋白相互作用與目標(biāo)抗體工作，這說(shuō)明了它的高特異性。事實(shí)上，它在單個(gè)位點(diǎn)消化意味著使用FabRICATOR時(shí)沒(méi)有過(guò)度消化的風(fēng)險(xiǎn)，其高特異性也意味著相同的消化方案可以作為平臺(tái)方法應(yīng)用于許多不同的抗體。FabRICATOR（IdeS）不需要還原條件來(lái)獲得良好活性，也不需要任何額外的輔助因子，它將在不同生理緩沖中發(fā)揮作用。這意味著按照下面的鉸鏈消解，您將生成F(ab’)2和Fc/2片段用于分析或其他應(yīng)用。

在Genovis，我們的策略是幫助客戶進(jìn)行中級(jí)（或亞基）分析，這是我們的工作，特別是我們的蛋白質(zhì)酶切產(chǎn)品。完整質(zhì)量和肽圖譜是蛋白質(zhì)表征的常用方法，我們發(fā)現(xiàn)，與簡(jiǎn)單但信息有限的完整質(zhì)量和高度復(fù)雜但信息豐富的肽圖譜相比，中級(jí)方法具有優(yōu)勢(shì)。通過(guò)執(zhí)行中級(jí)描述，您可以生成從完整的質(zhì)量實(shí)驗(yàn)中獲得的所有信息，具有額外的優(yōu)勢(shì)。在對(duì)抗體進(jìn)行完整質(zhì)量分析時(shí)，很難明確地識(shí)別某些修飾。質(zhì)譜儀器正在改進(jìn)，可以更有效地分析更大的分子，但通過(guò)使用我們的SmartEnzymes，如IdeS，可以將抗體分解成更小的片段，這提高了這些實(shí)驗(yàn)可以執(zhí)行的分辨率，因此，增加了鑒定修飾的信心。此外，你不僅能夠更好地識(shí)別修改，而且你能夠?qū)⑺鼈兌ㄎ坏降鞍踪|(zhì)上的單個(gè)結(jié)構(gòu)域，這是你在完整水平上無(wú)法做到的。可精確定位特定的修飾。而無(wú)需肽圖分析，可以較少的手動(dòng)操作時(shí)間快速完成。

蛋白酶用于生成肽，用于質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)。這些應(yīng)用包括蛋白質(zhì)組學(xué)和生物制藥的深度表征。由于遺漏了切割和樣品制備誘導(dǎo)的偽影，傳統(tǒng)的蛋白酶并不總是理想的，因此需要具有不同特異性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一種精氨酸特異性蛋白酶，可將蛋白質(zhì) C 末端消化為精氨酸殘基。與胰蛋白酶肽相比，所得肽更長(zhǎng)，并可能導(dǎo)致序列覆蓋率增加。質(zhì)譜分析中蛋白酶的特異性對(duì)于獲得高質(zhì)量的數(shù)據(jù)集和避免復(fù)雜的數(shù)據(jù)解釋至關(guān)重要。作為模型底物，使用胰島素氧化β鏈來(lái)比較 GingisREX 和 ArgC 的酶特異性。胰島素氧化β鏈含有一個(gè)精氨酸和一個(gè)賴氨酸殘基。在RP-HPLC和質(zhì)譜法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在賴氨酸殘基上沒(méi)有酶活性或其他額外活性，即使在長(zhǎng)時(shí)間孵育過(guò)夜后，酶與底物的比例也很高（1：5）。然而，ArgC在精氨酸殘基上顯示出主要活性，但在賴氨酸殘基上也可以看到酶消化。在酶與底物的比例為 1：20 和過(guò)夜孵育下，證明了 ArgC 的額外非特異性活性。在相同條件下，GingisREX未檢測(cè)到這種情況。數(shù)據(jù)證實(shí)了GingisREX精氨酸殘基的特異性活性，并顯示使用Arg-C在賴氨酸和其他殘基處的非特異性消化。Genovis酶的適應(yīng)于克隆篩選，工藝開(kāi)發(fā)和驗(yàn)證以及穩(wěn)定性研究，也適用于受控環(huán)境中的批次放行方法。海南GingisREXIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶

Genovis提供FabRICATOR （IdeS）驗(yàn)證包。三種不同批次的凍干酶，用于驗(yàn)證基于FabRICATOR的分析方法。海南GingisREXIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶

Genovis提供具有低水平內(nèi)Du素的FabRICATOR（IdeS）凍干酶，用于IgG的鉸鏈以下消化。FabRICATOR（IdeS）是一種IgG特異性半胱氨酸蛋白酶，可消化鉸鏈下方單個(gè)氨基酸位點(diǎn)的抗體，產(chǎn)生均質(zhì)的F（ab'）2和Fc片段。FabRICATORLowEndotoxin以凍干粉的形式提供兩種不同規(guī)格：2000和5000單位，分別用于消化2mg或5mgIgG。該產(chǎn)品配方每瓶的內(nèi)Du素含量較低，2000單位小瓶的內(nèi)Du素含量為<0.04EU/瓶，5000單位小瓶的內(nèi)Du素含量為<0.10EU/瓶。有效消化，內(nèi)DU素水平低；適用于靈敏的體內(nèi)或基于細(xì)胞的檢測(cè)。海南GingisREXIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶