我們知道WB實驗步驟繁瑣,一次實驗歷時也不短,從提蛋白到顯影結束可能要三天,我們就講一下這里面的一些關鍵環節。一、蛋白提取及變性1、提取蛋白很多經驗豐富的WB實驗者都深有體會,蛋白提取是影響結重要的環節之一。該過程重要的是防降解和保證蛋白濃度不要太低。防降解主要有兩點,一是裂解前注意保持樣品處于低溫環境中,二是裂解時加入足夠的蛋白酶抑制劑。我們習慣先用冰冷的PBS做心臟的體循環灌注,然后冰上取腦,分離各腦區(嗅球,皮層,海馬,中腦,小腦,延髓,丘腦,紋狀體)后置于,用液氮速凍后轉移至-80度冰箱長期保存。接著是保證蛋白濃度,即要加入適量的裂解液,加太少會使蛋白提取不充分,加太多會讓蛋白濃度太低,一般經驗是這樣的,細胞樣品例如一個六孔板的細胞加60微升的裂解液,動物組織的話每毫克組織加10微升裂解液。還要加上超聲破碎處理,具體方案見討論部分。如果沒有超聲破碎儀,那就用1毫升注射器不斷抽吸,冰上反復抽吸1分鐘左右,注意不要產生過多氣泡。(需要灌注取材的視頻可以私聊獲取,由于文件過大,又比較血腥,不宜直接放到文章里。)2、蛋白變性加入上樣緩沖液后100攝氏度煮10分鐘,這里的上樣緩沖液有兩種可選。干貨分享 | PCR反應污染原因追蹤及污染處理方法。黑龍江病理科研技術服務服務

1.首要原則:細胞不重要情況下立即丟棄,培養箱滅菌,所用培養基也都要丟棄,器械等重新滅菌或拆用新的。2.細菌污染一般都救不回來了,發現的時候培養基一般都很渾濁且細胞都死了3.污染且細胞很重要時:遇到念球菌污染,且細胞為基因改造細胞,非常重要。如231貼壁乳腺細胞,發現細胞周圍出現很小的串珠透亮圓點,非常像念球菌污染,此時細胞狀態尚可,且污染少。處理如下:用預熱或室溫PBS清洗3次,可適當振搖,將污染沖洗下來。隨后加入10-20%雙抗到培養瓶,置于37度培養箱1h,之后再用PBS清洗三遍,直至視野下無可見污染。此時細胞也被沖下大部分,因此此方法只適用在細胞貼壁強,狀態好,密度高時使用。之后每天再更換培養基,每次用PBS沖洗2遍。過幾天細胞狀態尚可時,消化離心時用500r,3min,去掉上清,重復3次。這個方法是根據文獻可利用念球菌和細胞體積重量差異實現分離。基本上這一步做完以后,污染就基本了,接下來就注意多觀察,勤換液就行。天津兔科研技術服務服務動物疾病模型還為科研人員提供了研究人類疾病的跨學科方法。

注意事項1.病毒包裝的幾個關鍵點主要包括:細胞因素、載體系統(盡量使用成熟的商業化載體系統)、構建重組的質粒正確與否、質粒抽提純化情況、包裝轉染控制(24、48小時的細胞及熒光狀態判斷)、目的基因對病毒包裝影響(基因大小、序列情況、蛋白功能毒性等都會影響到是否能包裝成功)。,需要觀察包裝病毒后的48h培養基顏色是否橙紅。3.病毒濃縮:病毒一般在48h和72h各收一次。如果不想濃縮病毒的話,也可以直接將收集的病毒上清作為要的細胞的培養基,但是可能效果會不太好。并且一般收病毒時,培養基的營養已經損耗了很多,那樣直接培養細胞會損害細胞,所以建議還是進行濃縮后再。常見問題1.包裝病毒時293T細胞狀態不好,或者鋪得過密,可以選擇放棄該次實驗。2.目的載體過大,不易。3.避免轉染過程以及后續過程出現的污染。
原理以慢病毒包裝為例,主要包括3個質粒:質粒DNA可以轉錄出慢病毒遺傳物質(RNA),但不能翻譯出慢病毒的外殼及蛋白成分的載體質粒,其同時含有目的基因和報告基因,psPAX2是可以表達慢病毒外殼的質粒,其表達產物可通過粘附機制更易穿過細胞膜。為慢病毒的膜蛋白質粒,通過脂質體進行三質粒共轉到靶細胞基因組中,宿主基因組在表達時,隨宿主基因轉錄出的目的基因RNA與psPAX2、基因翻譯出的蛋白組裝為慢病毒。病毒進入細胞后,其遺傳物質RNA逆轉錄出DNA,該基因再整合到靶細胞的基因組中,完成轉染過程。因為質粒DNA只能轉錄出病毒RNA和表達目的基因卻不能表達出病毒的外殼和膜蛋白成分,因此其不能像普通的病毒一樣在宿主細胞能反復增殖,故對宿主細胞是無害的并且高效的將目的基因轉染到靶細胞基因組中。用途病毒產生,包裝病毒。材料與儀器無菌1×PBS,對數期293T細胞,細胞計數器,病毒質粒(以慢病毒為例:psPAX2/),轉染試劑(lipMax或者lipo3000),Polybrene、病毒濃縮液(生物公司有售)等。步驟(1)293T細胞鋪板取對數生長期的293T細胞,用的胰蛋白酶消化293T細胞,計數。若是10cm大皿,建議按照10-12×106每皿的數量將293T細胞均勻鋪入。若是6孔板。細胞增殖與細胞凋亡、細胞周期等是研究的重要表型,是分子生物學和藥理學研究解決的問題之一。

m6A研究又有新手段了?趕緊來了解一下吧!欄目:研究動態發布時間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,目前主要的研究思路包括差異表達的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章,小編時間和大家分享一下。作者開發這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據這一原理,作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理,然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點,ACA處被完全剪切,測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析(圖3)。動物疾病模型在科研中有著普遍的應用。上海裸鼠科研技術服務技術
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二甲苯Ⅰ、Ⅱ各15min至透明。(2)放入二甲苯和石蠟等量混合液處理15min,再放入石蠟Ⅰ、Ⅱ透蠟各50~60min。透蠟在恒溫箱內進行,箱內溫度保持在55~60℃左右。4、包埋(1)用鑷子夾取蠟模在酒精燈上稍加熱,并倒入少許從溫箱中取出的純石蠟。(2)再將鑷子在酒精燈上稍加熱,夾取材料將切面朝下放入蠟模中,排列整齊,再放上包埋盒,輕輕倒入熔蠟。5、切片、展片、貼片(1)將包埋好的石蠟塊固定在切片機上,調整厚度調節器到所需的切片厚度,一般為4~6μm。(2)切下的組織薄片要放到加熱的水中燙平,再貼到載玻片上,放45℃恒溫箱中烘干。二、HE染色1、脫蠟、復水(1)保持水浴鍋溫度為60℃,將切片放入干燥的染色缸內,放入水浴鍋中,30min至蠟熔化。(2)石蠟切片經二甲苯Ⅰ、Ⅱ脫蠟各5min,然后放入100%、95%、90%、80%、70%各級酒精溶液中各3~5min,再放入蒸餾水中3min,以便染料可以進入組織。2、染色、脫水(1)切片放入蘇木精中染色約10~30min,用流水沖洗約15min,使切片顏色變藍。(2)將切片放入1%鹽酸乙醇液中褪色,幾秒后見切片變紅、顏色較淺即可,后將切片再放入流水中使其恢復藍色。(3)切片放入50%、70%、80%乙醇中各3~5min。黑龍江病理科研技術服務服務