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無錫JUE對(duì)定量數(shù)字PCR

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-12-22

       微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)在傳統(tǒng)的PCR擴(kuò)增前對(duì)樣品進(jìn)行微滴化處理,即將含有核酸分子的反應(yīng)體系分成成千上萬個(gè)納升級(jí)的微滴,其中每個(gè)微滴或不含待檢核酸靶分子,或者含有一個(gè)至數(shù)個(gè)待檢核酸靶分子。經(jīng)PCR擴(kuò)增后,逐個(gè)對(duì)每個(gè)微滴進(jìn)行檢測,有熒光信號(hào)的微滴判讀為1,沒有熒光信號(hào)的微滴判讀為0,根據(jù)泊松分布原理及陽性微滴的個(gè)數(shù)與比例即可得出靶分子的起始拷貝數(shù)或濃度。


與傳統(tǒng)PCR相比所具有的優(yōu)勢

       不依賴Ct值或內(nèi)參基因,即可確定低至單拷貝的待檢靶分子的***數(shù)目。微滴技術(shù)讓數(shù)字PCR更低成本,且更實(shí)用。





可使用第三方PCR反應(yīng)液,配備PCR A300(溫度范圍4°C-98°C,擴(kuò)增模塊溫控精度±0.2°C)。無錫JUE對(duì)定量數(shù)字PCR

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       數(shù)字PCR可以直接計(jì)算目標(biāo)序列的拷貝數(shù),因此無需依賴于對(duì)照樣品和標(biāo)準(zhǔn)曲線就可以進(jìn)行精確的***定量檢測;此外,由于數(shù)字PCR在進(jìn)行結(jié)果判讀時(shí)*判斷有/無兩種擴(kuò)增狀態(tài),因此也不需要檢測熒光信號(hào)與設(shè)定閾值線的交點(diǎn),完全不依賴于Ct值的鑒定,因此數(shù)字PCR的反應(yīng)受擴(kuò)增效率的影響**降低,對(duì)PCR反應(yīng)***物的耐受能力**提高;數(shù)字PCR實(shí)驗(yàn)中標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系分配的過程可以極大程度上降低與目標(biāo)序列有競爭性作用的背景序列濃度,因此數(shù)字PCR技術(shù)也特別適合在復(fù)雜背景中檢測稀有突變。寧波國產(chǎn)數(shù)字PCR原理全封閉體系,自動(dòng)化流程操作。

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       在定量PCR時(shí),我們常常糾結(jié)一個(gè)問題,究竟是相對(duì)定量還是***定量呢?如今,你無需糾結(jié)了,因?yàn)閿?shù)字PCR(digital PCR)來了。盡管這兩種技術(shù)有些類似,都是估計(jì)起始樣品中的核酸量,但它們有一個(gè)重要的區(qū)別。定量PCR是依靠標(biāo)準(zhǔn)曲線或參照基因來測定核酸量,而數(shù)字PCR則讓你能夠直接數(shù)出DNA分子的個(gè)數(shù),是對(duì)起始樣品的***定量。因此特別適用于依靠Ct值不能很好分辨的應(yīng)用領(lǐng)域:拷貝數(shù)變異、突變檢測、基因相對(duì)表達(dá)研究(如等位基因不平衡表達(dá))、二代測序結(jié)果驗(yàn)證、miRNA表達(dá)分析、單細(xì)胞基因表達(dá)分析等。

       數(shù)字PCR檢測及分析原理在上世紀(jì)90年代就被提出來了,但是無奈受限于當(dāng)時(shí)的技術(shù)條件,樣本稀釋及分配都是靠手工來完成的,受到很多因素的干擾和限制;并且結(jié)果分析對(duì)于研究者來說也十分枯燥與繁瑣,因此在很長一段時(shí)間dPCR發(fā)展停滯不前。后來由于微流控技術(shù)與微納集成制造工藝的發(fā)展解決了dPCR過程中的幾個(gè)關(guān)鍵技術(shù)問題,推動(dòng)了dPCR的研究與商業(yè)化的發(fā)展。


       目前根據(jù)dPCR樣本稀釋分配的方式,基本可分為三大類,一種是基于大規(guī)模集成微流控芯片;第二種是使用微反應(yīng)室/孔板;第三種是微滴式。但不論是走芯片式還是微滴式,其基本原理都是將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應(yīng)器或者微滴當(dāng)中,每個(gè)反應(yīng)器的核酸模板數(shù)少于1或者等于1。經(jīng)過PCR擴(kuò)增之后,有一個(gè)核酸分子的模板的反應(yīng)器就會(huì)給出熒光信號(hào),沒有模板的反應(yīng)器沒有熒光信號(hào)。根據(jù)相對(duì)比例和反應(yīng)器的體積,可以推算出原始溶液的核酸濃度。 理論上可覆蓋qPCR(熒光定量PCR)的所有應(yīng)用。

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       要了解為什么傳統(tǒng) PCR 存在限制,務(wù)必要了解 PCR 反應(yīng)過程中發(fā)生了什么。基本 PCR 運(yùn)行可以分為三個(gè)階段:

指數(shù)期

       每個(gè)循環(huán)積聚的產(chǎn)物準(zhǔn)確加倍(假定 ** 反應(yīng)效率)。該反應(yīng)具有高度特異性和精確度。出現(xiàn)指數(shù)式擴(kuò)增,因?yàn)樗性噭┚迈r可用,反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)推動(dòng)反應(yīng)有利于擴(kuò)增子加倍。

線性期(高變異性)

       隨著反應(yīng)繼續(xù),一些試劑因擴(kuò)增而被消耗。反應(yīng)開始減緩,并且每個(gè)循環(huán)的 PCR 產(chǎn)物不再加倍。

平臺(tái)期(終點(diǎn):使用傳統(tǒng)方法進(jìn)行凝膠檢測)

       反應(yīng)停止,不再產(chǎn)生更多產(chǎn)物,并且如果放置時(shí)間夠長,PCR 產(chǎn)物將開始降解。因?yàn)槊總€(gè)樣品具有不同的反應(yīng)動(dòng)力學(xué),所以每支試管或每個(gè)反應(yīng)將在不同的時(shí)間點(diǎn)進(jìn)入平臺(tái)期。在平臺(tái)期可以看到這些差異。在平臺(tái)期內(nèi),傳統(tǒng) PCR 進(jìn)行測量,又稱為終點(diǎn)檢測。 準(zhǔn)確度不完全依賴于擴(kuò)增效率。廣州廣州永諾數(shù)字PCR原理

超高靈敏度,適用于稀有序列及稀有突變的檢測。無錫JUE對(duì)定量數(shù)字PCR

       數(shù)字PCR通過將一個(gè)樣本分成幾十到幾萬份,分配到不同的反應(yīng)單元(微滴),包含一個(gè)或多個(gè)拷貝的核酸分子(也就是說我們所說的 DNA 模板) ,這是與PCR或qPCR反應(yīng)比較大的區(qū)別,PCR或qPCR只在一個(gè)反應(yīng)體系中進(jìn)行,而數(shù)字PCR在每個(gè)反應(yīng)單元(微滴)中都會(huì)對(duì)目標(biāo)分子進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增結(jié)束后統(tǒng)計(jì)熒光信號(hào)并分析。是不是聽起來特別高(yi)大(lian)上(meng)?舉個(gè)栗子,PCR或qPCR檢測突變像是在大海里撈一個(gè)會(huì)發(fā)光的針,周圍都是海水,很難看到針的光在哪,而dPCR就像把海水盛到好多個(gè)碗里面,瞧一眼很容易就知道哪個(gè)碗在發(fā)光了,而且,系統(tǒng)還會(huì)數(shù)出來到底有多少個(gè)碗里是發(fā)光的,多少個(gè)碗里是沒發(fā)光的,這樣一比,不就很容易的知道有多少數(shù)量的突變,就能做到***定量了。無錫JUE對(duì)定量數(shù)字PCR

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