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噬菌體展示的Fab也可用于開發針對病原體的治療性抗體。針對病毒的特異性Fab的篩選主要針對病毒復制過程中的關鍵蛋白，抑制病毒對機體的入侵從而達到治療目的。近些年合成Fab噬菌體庫針對多個靶標已成功篩選出了多種潛在治療性分子，如針對人類免疫缺陷病毒包膜蛋白gp41的Fab3674抗體，SARS-CoV-2受體結構域的阻斷抗體rRBD-15以及乙肝病毒L蛋白的preS1基序分子的1A8單抗等。這說明噬菌體展示技術不僅能幫助確定病毒靶點，還對治療性的藥物的開發具有極其重要的意義。

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